(二)專書論文
02. 2007,〈何謂人:論胎兒的存有地位與墮胎之惡〉,收入《墮胎議題面面觀:基督徒醫學倫理列4》,張立明主編,臺中市:路加傳道會,2008。
03. 1998,〈死亡、上帝與將來:基督教終末教義的一個初步闡述〉,收入《末世與希望》,沈清松主編,臺北市:五南圖書,1999,頁227-56。
(三)期刊論文
01. 2012,〈上帝、道德與權利:兼論當代生命倫理學爭論中的成人主義偏見〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第23期,頁33-62。
08. 2010,〈愛的教訓:十誡的意義〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第20期,臺北市:臺灣基督徒學會,頁29-93。
09. 2010,〈死刑的理由:一個根據《聖經》的倫理神學觀點〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第19期,臺北市:臺灣基督徒學會,頁59-111。
11. 2009,〈愛、自然的價值與環境倫理〉,《應用倫理評論》,第47期,桃園:國立中央大學哲學研究所應用倫理研究中心,頁137-160。
12. 2009,〈上帝的主權:加爾文的政治神學與基督徒的政治倫理〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第18期,臺北市:臺灣基督徒學會,頁41-66。08.
13. 2009,〈理解聖經〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第17期,臺北市:臺灣基督徒學會,頁121-176。
17. 2007,〈何謂人:論胎兒的存有地位與墮胎之惡〉,《獨者:臺灣基督徒思想論》第14期,臺北市:臺灣基督學會,頁77-122。
18. 2007,〈婚姻、命運、上帝:讀〈路得記〉〉,第13期,臺北市:臺灣基督學會,頁221-253。
19. 2006,〈婚姻的意義〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第12期,臺北市:臺灣基督學會,頁31-60。
20. 2006,〈反-同性戀主義:一個哲學、神學與信仰實踐的批判〉,《獨者:臺灣基徒思想論刊》,臺北市:臺灣基督學會,第12期,頁143-192。
21. 2006,〈愛只喜歡真理:駁《同性戀議題研究方案報告書》的神學謬論〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,臺北市:臺灣基督學會,第12期,頁257-28。
22. 2006,〈窮德見恩:基督信仰的倫理精神〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》, 臺北市:臺灣基督學會,第11期,頁201-261。
23. 2005,〈有情有義的上帝:議兩種非基督思想與基督教以悼念S. A.Kierkegaard逝世150週年〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第10期,臺北市:臺灣基督學會,頁39-81。
24. 2005,〈實踐、智慧與悲劇信仰〉,《山道期刊》,第8卷第2期,香港:浸信會神學院,頁57-78。
25. 2005,〈基督信仰的上帝說:回應曾慶豹〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第9期,頁199-226。
26. 2004,〈唯獨上帝的眼光:評「新眼光讀經運動」說帖的解經學與神學眼光〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第8期,頁101-153。
27. 2004,〈惡、人性與倫理學:駁F. M. Wuketits的演化論倫理學解釋〉,《台灣人文生態研究》,第6卷第2期,頁23-39。
28. 2004,〈道德實踐與生命意義〉,《哲學與文化》,第31卷第9期,頁59-74。
29. 2004,〈保羅、雅典、臺灣:從保羅在雅典談面對臺灣文化的基督信仰〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第6期,頁31-62。
30. 2004,〈惡、無神論、信仰:呂格爾重認基督信仰的後宗教進路〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第6期,頁123-167。
31. 2003,〈如何說避免言說上帝說:回應曾慶豹的〈如何避免言說「上帝說」:聖經詮釋的否定式神學〉〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第3期,頁87-104。
32. 2003,〈義意成為實在:基督信仰的本質與聖經的徹底詮釋〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第2期,頁105-149。
33. 2003,〈合法墮胎條件不當如此空泛:呼應修改「優生保健法」第三章第九條第一項第六款的提議〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第1期(創刊號),頁13-20。
34. 2003,〈聖經詮釋的主觀性與客觀性:與一般詮釋學比論聖經詮釋學的獨特性〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第1期(創刊號),頁73-108。
35. 2002,〈道德困境與虛己倫理:以兩種困境墮胎類型為例的倫理神學反思〉,《神學與教會》,第27卷第2期,頁319-344。
36. 2002,〈婚姻中的基督──婚姻意義的神學反思〉,《神學與教會》,第27卷第1期,頁82-110。
37. 2001,〈詮釋的辯證與自我的反思:呂格爾的詮釋學〉,《臺灣人文生態研究》,第3卷第2期,頁1-23。
38. 2001,〈呂格爾對惡的理解〉,《神學與教會》,第26卷第2期,頁269-289。
39. 2001,〈《聖經》對同性戀的雙面倫理觀〉,《神學與教會》,第26卷第1期,頁67-95。
40. 2001,〈宰制或恩澤:論現代科技之偏離及其復歸之可能性〉,《臺灣人文生態研究》,第3卷第1期,頁35-52。
41. 2000,〈惡的詰難:康德根本惡說的反思〉,《哲學與文化》,第27卷第12期,頁1114-1128。
42. 1999,〈苦難與上帝形像之更迭:取道呂格爾的反思〉,《神學與教會》,第25卷第1期,頁231-49。
43. 1996,〈惡之終始:呂格爾早期主體存有學對惡的反思〉,《哲學雜誌》,第15期,頁178-207。
44. 1995,〈對著惡的良知:從惡的問題重估王陽明的心學理論〉,《關渡基督書院學報》,第2期,頁61-82。
45. 1994,〈從「自律」概念論康德與孟子二者道德理論之基本形態的同異〉,《關渡基督書院學報》,創刊號,頁105-120。
46. 1992,〈個我與歷史:對蔣慶先生「基督信仰與中國文化」一文的反省〉,《鵝湖月刊》,第18卷3期,頁34-41。
(四)會議論文
01. 2014,〈聖經與自由:一個經典教育的範例,兼論通識教育的目的與困境〉,11月1-2日,臺中市:中華民國通識教育學會、東海大學通識中心主辦,「21世紀人文教育與通識教育的危機與展望研討會」。
04. 2010,〈猶太人的創造性根源:回應張平教授〉。3月22-23日,臺北市:中央研究院中國文哲研究所主辦,「猶太與中國傳統的對話」國際學術研討會。 臺北市中央研究院中國文哲研究所。
06. 2009,〈上帝的主權:加爾文的政治神學與基督徒的政治倫理〉,11月21日,臺北市:中國福音會,「改革宗信仰在中國研討會」。
08. 2007,〈論胎兒的存有地位與墮胎之惡〉,4月28日,嘉義市:財團法人嘉義基督教醫院、路加傳道會(CCMM)合辦,「基督徒醫學倫理研討會:墮胎議題面面觀」,收入《墮胎議題面面觀:基督徒醫學倫理列4》,張立明主編,臺中市:路加傳道會,2008。
09. 2006,〈愛的意義〉,5月19-21日,臺北市:教育部暨臺灣生命教育學會,「科際整合之生命教育學術研討會」,《會議手冊暨論文集》,頁163-175。
10. 2004,〈婚姻的意義:兼論性與愛情的道德〉,9月18日,臺北市:台灣生命教育學會籌備委員會,「生命教育核心議題研討會」。
12. 2000,〈宰制或恩澤:論現代科技之偏離及其復歸之可能性〉,5月15日,臺中沙鹿:靜宜大學文學院,「第一屆全國現代思潮學術研討會」。
13. 2000,〈辯證與反思的詮釋學:呂格爾〉,12月1-2日,桃園中壢:中原大學,「宗教學術研討會」。
14. 1998,〈死亡、上帝與將來:基督教終末教義的一個初步闡述〉,12月,臺北市,中國哲學會與太平洋文化基金會,「末世與希望學術研討會」,收入《末世與希望》,沈清松主編,臺北:五南,1999,頁227-56。
15. 1997,〈過錯、受苦與救贖:呂格爾論惡的基本進路與意圖〉,12月20日,臺北市:中國哲學會,「惡與痛苦學術研討會」。
16. 1997,〈拆解偶像的基督信仰──資本主義化之教會文化的一個慾望語意學分析〉,2月12日,臺北市:基督教傳播人團契,「1997基督徒傳播年會」,修訂為〈拆解偶像的基督信仰──資本主義教會文化的一個慾望語意學反思〉,刊於《獨者 臺灣基督徒思想論刊》,第四期,2003,頁165-177。
17. 1990,〈良知心與惡:從惡之存在反省王陽明的心學及其隱含的人論立場〉,12月26-27日,臺北市:中央研究院中國文哲研究所籌備處,「中國文學與哲學研究生論文發表會」。
(五)書序
01. 2015,〈基督徒的生態職責〉,《關顧受造世界:基督教對環境的關懷與行動》, 理察‧包衡, 羅伯特‧貝瑞/等著,新北市:聖經資源中。
(六)講稿與發言稿
07. 2012,〈愛與環境〉,10月29日,台北市︰台灣師範大學環境教育研究所。11月8日,高雄縣:中山大學。
12. 2011,〈土地倫理〉,10月14日,台中市:靜宜大學生態人文學系「生態人文學家咖啡館:生態人文詞典」。
14. 2011,〈動物權利〉,6月12日,台中縣:靜宜大學生態人文學系「生態人文學家咖啡館:生態人文詞典」。
(七)網路文章
02. 2015,〈說謊〉,6月27日,「愛 真理 生命:柯志明教授部落格」。
03. 2015,〈正義要求死刑〉,6月09日,「愛 真理 生命:柯志明教授部落格」。
07. 2015,〈希望在天上〉,3月15日,「愛 真理 生命:柯志明教授部落格」。
08. 2015,〈不可害死人〉,2月28日,「愛 真理 生命:柯志明教授部落格」。
09. 2015,〈政治的魅惑〉,1月15日,「愛 真理 生命:柯志明教授部落格」。
10. 2014,〈為何因死哀痛〉,12月18日,「愛 真理 生命:柯志明教授部落格」。
12. 2014,〈刑罰與教化〉,10月05日,「愛 真理 生命:柯志明教授部落格」。
16. 2014,〈死亡與自由〉,4月18日,「愛 真理 生命:柯志明教授部落格」。
18. 2013,〈雖然之愛〉,12月14日,「愛 真理 生命:柯志明教授部落格」。
(八)雜誌、通訊文章
01. 2007,〈你為倒下:給摯友鄭榮洲的一封信〉,收入《無情漸凍有情天:鄭榮洲文集》,臺中:靜宜大學人文教育中心,頁339-350。
02. 2007,〈教育、哲學與大學通識教育:一個哲學的分析與反省〉,《國家與教育》,第2 期,臺中市:臺灣教師聯盟,頁88-98。
03. 2006,〈追隨耶穌基督〉,《獨者 臺灣基督徒思想論刊》,第11期,頁25-37。
04. 2005,〈被判死刑的上帝:Mel Gibson的電影《基督受難記》觀後感〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第10期,頁239-246。
05. 2005,〈您是誰的鄰舍?〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第9期,頁19-32。
06. 2004,〈信,艱難的歡悅〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第8期,頁17-33。
07. 2004,〈基督徒或基督教無神論者〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第5期,頁13-29。
08. 2004,〈神國已臨,我們應當悔改:回應蔡彥仁的「重返神國」〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第5期,頁185-194。
09. 2003,〈面向將來的基督〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第4期,頁191-194。
10. 2003,〈解經的生活〉,《釋經與生活》,第2期,頁2-4。
11. 2003,〈獨者之路〉,《獨者:臺灣基督徒思想論刊》,第1期(創刊號),頁7-11。
12. 2002,〈性命之悲喜〉,《走出埃及禱告事奉中心季刊》,第32期,頁2-4。
13. 2002,〈為何「國家」祈禱「早餐會」?〉,《曠野》,第119期,頁7-9。
14. 2002,〈道德兩難中的「我與你」:在兩種墮胎類型裡的神學冥想〉,《台灣基督徒學會通訊》,第五期,頁1-28。
15. 2002,〈與稗子並生〉,《曠野》,第117期,頁16-17。
16. 2001,〈閃亮的烏利亞〉,《曠野》,第115期,頁24-25。
17. 2001,〈必須分辨〉,《曠野》,第113期,頁14-15。
18. 2001,〈請在暗中誠心為臺灣禱告:對教會舉行「國家祈禱早餐會」的一點意見〉,《曠野》,第110期,頁5-7。
19. 2000,〈略論基因研究及其應用技術的效應與限制〉,《靜宜大學新聞深度分析簡訊》,第80期,頁1-8。
20. 1999,〈批判的基督信仰:與現代文化的批判性比論〉,《曠野[跨世紀小百科]》,第18期,頁58-68。
21. 1998,〈科技與存在之陰暗〉,《曠野[跨世紀小百科]》,第11期,頁53-60。
22. 1998,〈女性主義正反論〉,《曠野[跨世紀小百科]》,第8期,頁20-30。
23. 1997,〈消費文化:一種致命的迷惑與宰制〉,《曠野[跨世紀小百科]》,第4期,頁10-17。
24. 1997,〈半調子的占星術〉,《新使者》,第41期,頁34-37。
25. 1997,〈同性戀合理?〉,《新使者》,第39期,頁63-65。
26. 1997,〈基督徒的EQ高嗎?〉,《新使者》,第38期,頁11-13。
27. 1996,〈信倒錯的性神學:讀《同志神學》的一點反應〉,《曠野》,第84期,頁14-17。
28. 1996,〈存在非即合理:同性戀是合理的存在方式嗎?〉,《曠野》,第80期,頁6-7。
(九)報紙文章
01. 2001,〈誰的手?〉,《台灣教會公報》,第2588期,頁15。
02. 2001,〈忍耐虛無之量〉,《台灣教會公報》,第2577期,頁15。
03. 2001,〈「我」的命運與盼望〉,《靜宜知音》,第8期,頁2。
04. 1997,〈脆弱的人權〉,《台灣教會公報》,第2386期,頁6。
05. 1997,〈說到要做到〉,《台灣教會公報》,第2341期,頁6。
06. 1996,〈懺悔!〉,《台灣教會公報》,第2337期,頁3。
07. 1996,〈惡魔天空下的小丑與騙子〉,《台灣教會公報》,第2330期,頁3。
08. 1996,〈討人厭的信仰〉,《台灣教會公報》,第2323期,頁19。
09. 甲、1996,〈鬼與半調子〉,《台灣教會公報》,第2323期,頁3。
10. 1996,〈基督是臺灣的存在根基〉,《台灣教會公報》,第2316期,頁3。
11. 1996,〈基督徒無神論者〉,《台灣教會公報》,第2313期,頁18。
12. 1996,〈拆解假象〉,《台灣教會公報》,第2309期,頁3。
13. 1996,〈無血無淚的「基督徒知識份子」之傷心:兼論《基督教論壇報》對臺灣人的傲慢與偏見〉,《台灣教會公報》,第2300期,頁21。
14. 1996,〈從「實體」到「自我」〉,《台灣教會公報》,第2300期,頁3。
15. 1996,〈垃圾與烈火〉,《台灣教會公報》,第2296期,頁11。
16. 1996,〈決心離棄壞傳統〉,《台灣教會公報》,第2291期,頁3。
17. 1996,〈末世意識與基督徒的生命氣度〉,《基督教論壇報》,第1553期,頁7。
18. 1995,〈有意義地活〉,《台灣教會公報》,第2282期,頁3。
19. 1995,〈愛的管教:從教師可否有管教權說起〉,《基督教論壇報》,第1544期,頁7。
20. 1995,〈宗教對談的危機〉,《基督教論壇報》,第1531期,頁7。
21. 1995,〈可說與不可說〉,《基督教論壇報》,第1502期,頁7。
22. 1995,〈邏輯所能做的:回應〈信仰合乎邏輯嗎?〉一文〉,《基督教論壇報》,第1500期,頁7。
23. 1994,〈誰是基督的工人?:兼論神學院的角色與功能〉,《基督教論壇報》,第1477期,頁7。
24. 1993,〈說出基督之道〉,《基督教論壇報》,第1438期,頁7。
25. 1992,〈燒香、祭祖、孝道?:論基督徒可否拿香祭祖及其呈現的教會實況〉,《基督教論壇報》,第1374期,頁4。
26. 1992,〈教會中理性的沒落:情緒的反智與敬畏的理性〉,《基督教論壇報》,第1359期,頁4。
(十)書籍文章
01. 1998,〈慰藉〉,《心靈之旅選:國軍第三十四屆文藝金像獎文字類作品選》,頁1-10,本文為第三十四屆國軍文藝金像獎文字類散文組首獎作品。
02. 1996,〈渴望卻不可知的靈魂不朽〉,《靈魂CALL OUT》,臺北:商周文化,頁214-232。